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中华人民共和国南充海关是受中华人民共和国成都海关直接领导，按授权负责南充市行政区划范围内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务 <ref>[https://www.sohu.com/a/303577608_100081496 关务是什么？海关主要负责哪些？]，搜狐，2019-03-25</ref> ，反馈执法作业结果；完成中华人民共和国成都海关交办的其他工作。功能化类型为属地型。

近年来，南充海关始终坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，紧紧围绕中心工作，切实加强理想信念教育，深入践行社会主义核心价值观 <ref>[https://www.sohu.com/a/488138195_121106994 社会主义核心价值观24字，一看就懂！]，搜狐，2021-09-06 1</ref> ，着力推进文明创建、文明培育、文明实践工作，全力厚植精神文化沃土，用心浇灌文明之树，让海关文明之花“香飘四溢”。南充海关于2012年被南充市授予“市级文明单位”荣誉称号，2019年被授予“市级最佳文明单位”。