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黄埔海关管辖区域既是华南地区重要的海上对外贸易 <ref>[https://business.sohu.com/a/592623924_121433015 2023-2028年中国对外贸易行业市场预测与投资规划分析报告] ，搜狐，2022-10-14 </ref> 口岸，也是我国加工贸易开展最早、密度最大的地区之一。黄埔关区所辖“两区一市”外向型经济发达，监管业务涵盖了除空运以外的所有运输方式，业务门类相对齐全，既有口岸通关，也有属地监管。狭小的关区范围内密布着57个海关监管作业场所、27个集中作业场地、4个海关特殊监管区域、69个保税监管场所，注册企业总数6万多家。

黄埔海关是广东省内7个直属海关之一，其前身系清政府于康熙24年（公元1685年）在广东设置的粤海关黄埔挂号口，1949年新中国成立以后设置为黄埔分关，1980年7月直属海关总署领导，1988年8月升级为副厅级单位，2000年11月升级为正厅级单位，2018年新一轮机构改革后，出入境检验检疫管理职能和队伍划入海关。现设副厅（局）级机构2个，正处级内设部门21个、正处级派出机构14个（下设3个副处级办事处），全关在编干部职工4500余人。 [1] 黄埔海关管辖区域既是华南地区重要的海上对外贸易口岸，也是我国加工贸易开展最早、密度最大的地区之一。关区范围包括广州市黄埔区、增城区和东莞市，面积约4658平方公里。黄埔关区所辖“两区一市”外向型经济发达，监管业务涵盖了除空运以外的所有运输方式，业务门类相对齐全，既有口岸通关，也有属地监管。狭小的关区范围内密布着57个海关监管作业场所、27个集中作业场地、4个海关特殊监管区域、69个保税监管场所，注册企业总数6万多家。

承担关区出入境动植物及其产品的检验检疫、监督管理工作，按分工组织实施风险分析和紧急预防措施，承担出入境转基因生物 <ref>[https://www.sohu.com/a/296344225_120022037 关于转基因生物我们应该如何看待（上）] ，搜狐，2019-02-22</ref> 及其产品、生物物种资源的检验检疫工作。承办黄埔海关交办的其他工作事项。