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浙江省疾病预防控制中心是直属于浙江省卫生厅的卫生事业单位（监督管理类），承担政府公共卫生技术管理职能。对外挂牌浙江省卫生检验监测中心、浙江省中毒控制中心和浙江省预防医学研究中心。中心是浙江省委、省政府授牌的省级文明单位 <ref>[https://www.sohu.com/a/283628681_100009173 【文明创建】文明单位创建，要牢牢掌握这些要点内容！] ，搜狐，2018-12-21</ref> 。

中心内设32个科（所、室），其中职能科室11个，业务科室21个；现有职工324人，拥有各类专业技术人员282人，其中高级职称80人，硕士研究生以上学历58人；省“151人才”工程专家7人，各类学科带头人6人，硕士生兼职导师14人；享有国务院特殊津贴人员12人；省部级有突出贡献中青年专家1人;全国及省级劳模2人。中心建有一批国家和省级重点实验室和重点学科，如流行性出血热重点实验室、浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室、艾滋病 <ref>[https://www.sohu.com/a/504190782_121106994 关于艾滋病，这些知识你必须知道！]，搜狐，2021-11-29</ref> 确认实验室等。拥有液相色谱质谱联用仪、双聚焦高分辨磁质谱联用仪、全自动DNA测序仪、病毒载量仪、FACS流式细胞仪等高精尖仪器设备；中心的各类标准项目通过了国家实验室认可和国家级计量认证；获取了职业卫生技术服务资质（甲级）；通过了公共场所集中空调通风系统卫生学评价机构资质技术评估。近年来在预防医学和公共卫生领域取得包括国家科技进步一等奖在内的国家级科技成果17项，省部级科技成果117项，厅级科技成果60项，流行性出血热疫苗研制等一批科研成果已转化为生产力，取得十分显着的社会效益和经济效益。

2021年4月27日，中华全国总工会决定，授予浙江省疾病预防控制中心全国五一劳动奖状。[1]