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特定的色素因其來源材料不同，也可能會違反部分素食主義或宗教基本教義。 例如天然色素胭脂紅，其來源是從胭脂蟲中萃取所得，食用上會違反素食主義規範。

天然著色劑主要是指由動、植物組織中提取的色素，多為植物色素，包括微生物色素、動物色素及無機色素。常用的天然著色劑有辣椒紅、甜菜紅、紅曲紅、胭脂蟲紅、高粱紅、葉綠素銅鈉、薑黃、梔子黃、胡蘿蔔素、藻藍素、可可色素、焦糖色素等等。天然著色劑色彩易受金屬離子、水質、pH值、氧化、光照、溫度的影響，一般較難分散，染著性、著色劑間的相溶性較差，且價格較高。

== 合成著色劑 ==