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学院由五系（中药资源与鉴定系、 [[ 中药 ]] 炮制与制剂系、药理学系、 [[ 药物 ]] 化学与分析系、 [[ 生物 ]] 制药与食品科学系）、两中心（实验教学中心、分析测试中心）和两合建学院（新中药学院、康缘中药学院）组成。与中科院上海药物所合作共建“新中药学院”、与[[中国中医科学院]]合作开办中药学“屠呦呦班”，探索培养卓越科学家（中药学“4+5”本博连读创新拔尖人才）；与附属康缘药业合作共建“康缘中药学院”，探索培养卓越[[工程师]]<ref>[https://www.sohu.com/a/270981016_367117 卓越工程师 [[ 教育 ]] 培养计划、卓越医生教育培养计划2.0来了 ]，搜狐，2018-10-24</ref>（中药学“4+3”创新应用人才）。下设三个委员会：学术委员会、学位委员会、教学委员会。

中药学学科为“[[双一流]]” [[ 建设 ]] 学科、国家重点学科、 [[ 江苏 ]] 省优势学科，在全国第四轮学科评估中中药学进入A类，药理学与毒理学学科、 [[ 化学 ]] 学科进入ESI全球排名前1%。中药资源化学、中药炮制学、中药药理学、中药药剂学、中药化学和药用植物学6个学科为[[国家中医药管理局]]重点学科。药学为江苏省重点学科。

本科专业有中药学、中药资源与开发、中药制药、药学、药剂学、[[制药工程]]、生物制药、食品质量与安全等8个，其中与澳大利亚Griffith University合作举办生物制药（3+1）双学位项目，与澳大利亚RMIT University合作举办食品 [[ 质量 ]] 与安全（3+1）双学位项目。2019年中药学、药学专业入选国家级一流本科专业建设点，中药资源与开发为国家特色专业，[[中药学]]、药学<ref>[https://www.sohu.com/a/451969968_120824588 考研常识课：药学，中药学，中医学这三个专业有啥区别？ ]，搜狐，2021-02-23</ref>、中药制药、生物制药（中外合作办学）和食品质量与安全（中外合作办学）专业入选省级一流本科专业 [[ 建设 ]] 点。硕士学位点有药学、中药学一级学科科学学位硕士点和专业学位硕士点；博士学位点有中药学一级学科博士学位授权点，形成了本科、[[硕士]]、[[博士]]完整的教学层次和人才培养体系。中药学学科设有博士后流动站。

学院在职职工230余人，专任教师中具有博士学位教师占75%，具有硕士学位教师占22%，有[[教授]]（研究员）50名，副教授（副研究员）86名，其中国家973计划首席科学家1人、长江学者2人、国家杰青6人、中组部万人计划专家1人、国家优青1人、中组部青年千人1人、岐黄学者1人、何梁何利基金科学与技术创新奖1 人，国家有突出贡献中青年专家2人、全国师德建设先进个人1人、国家药典委员会委员2人、全国中医药高等学校教学名师、全国中医药杰出贡献奖、全国优秀教师、全国优秀 [[ 科技 ]] 工作者、[[江苏省]]特聘教授、江苏省“五一”劳动奖章获得者、江苏省“333”高层次人才等众多优秀专家人才。中药学、药学学科有[[博士]]研究生导师40名，硕士研究生导师96名。

近年来，学院专家牵头承担国家自然科学基金重大/重点项目、国家重点研发计划、国家重大新药创制专项等科研项目；先后获国家科学技术进步奖二等奖3项、国家 [[ 技术 ]] 发明奖二等奖1项、省部级科学技术奖一等奖5项、国家[[研究生]]教学成果二等奖1项、江苏省教学成果奖二等奖1项、江苏省研究生教学改革成果奖二等奖1项，新药证书1项，新药临床批件3项。近2年在Nature、Science、JAMA、JAMA Oncology、Journal of Clinical Oncology、Nature Communication等杂志发表多篇高水平论文。有国家精品在线开放课程2门、国家虚拟仿真实验项目1项、主编国家行业规划教材38部。