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细菌可产生内、外毒素及侵袭性酶，与 [[ 细菌的致病性 ]] 密切相关。细菌毒素可以区分为两种：放到菌体外的称为菌体外毒素（exotoxin）；含在体内的，在 [[ 菌体 ]] 破坏后而放出的，称为菌体内毒素（endoto－xin）。但是在菌体外毒素中，也有通过菌体的破坏而放出体外的，所以这种区分法并不是很严密的。菌体外毒素大多是蛋白质，其中有的起着酶的作用。 [[ 白喉杆菌 ]] 、 [[ 破伤风杆菌 ]] 、肉毒杆菌等的毒素均为菌体外毒素。而菌体内毒素，其 [[ 化学 ]] 主体是来自 [[ 细菌细胞壁 ]] 的脂多糖和蛋白质的复合体，赤痢杆菌、霍乱弧菌及绿脓杆菌等的毒素都是这方面的例子。

内毒素（endotoxin）即 [[ 革兰氏阴性菌 ]] 细胞壁的脂多糖，其毒性成分为类脂a。菌体死亡崩解后释放出来。外毒素(exotoxin)是由革兰氏阳性菌及少数革兰氏阴性菌在生长代谢过程中释放至菌体外的蛋白质。具有抗原性强、毒性强、作用特异性强的突出特点。某些细菌可产生具有侵袭性的酶，能损伤机体组织，促进细菌的侵袭、扩散，是细菌重要的致病因素，如链球菌的 [[ 透明质酸酶 ]] 等。

杆菌毒素是一种属于噬菌毒素的致命性噬菌毒素，专门感染 [[ 大肠杆菌 ]] 。其病毒体内含DNA，DNA的组成次序包括有线状双股、末端冗余（terminally redundant）以及 [[ 环状排列 ]] （circularly permuted）。外侧拥有由蛋白质组成的外壳。此外，此病毒中唯一含有磷原子的分子是DNA。