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按照《自贡市机构改革方案》，新组建的自贡市卫生健康委员会整合了市卫生和计划生育委员会、市深化医药卫生体制改革领导小组办公室，以及市民政局的市老龄工作委员会办公室、市安全生产监督管理局的职业健康监督管理等职责，作为市政府工作部门，挂市中医药管理局牌子。整合后不再保留市卫生和计划生育委员会、市深化医药卫生体制改革 <ref>[https://www.sohu.com/a/472847925_121106875 【一图读懂+全文】深化医药卫生体制改革2021年重点工作任务来了] ，搜狐，2021-06-18</ref> 领导小组办公室。市老龄工作委员会的日常工作由市卫生健康委承担。

（三）制定并组织落实全市疾病预防控制规划、免疫规划、以及严重危害人民健康的艾滋病等重大传染病、寄生虫病、地方病等公共卫生问题的干预措施。负责全市卫生应急工作，组织和指导全市突发公共卫生事件预防控制和各类突发公共事件的医疗卫生救援。依照国家检疫传染病 <ref>[https://www.sohu.com/a/464858810_121106994 全国近5年传染病情况，每个人都应该了解]，搜狐，2021-05-06</ref> 和监测传染病目录，参与开展检疫监测工作。