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1986年6月，召开了第二次代表大会，全区15全地州市和36个县（市）成立辅导员协会，会员达3400余名。学会先后召开过5次代表大会，选举产生过5届理事会。长期以来，在中国青辅协的指导下和自治区科协的领导下，在自治区科协学会学术部和其它有关部门的支持下，新疆青辅协努力发挥推动青少年科技教育事业的作用，开展了一系列符合我国科技教育工作发展趋势，满足会员、科技辅导员需求的业务培训、学术交流 <ref>[https://www.sohu.com/a/298032164_100191228 未来的学术交流的方式] ，搜狐，2019-02-27</ref> 、科技竞赛、实践活动、表彰优秀等活动，推动了自治区青少年科技教育工作的发展。

开幕式上，中国科协青少年科技中心、中国青少年科技辅导员协会共同向全国青少年科技教育工作者正式发出“科创筑梦”科普行动倡议书。倡议呼吁全国青少年科技教育 <ref>[https://www.sohu.com/a/472806986_99995131 科技教育对孩子的成长到底有多重要？]，搜狐，2021-06-18</ref> 工作者主动作为、勇于担当，携手助力青少年科学素质提升和培养创新后备人才工作。广大科技教育工作者表示，会从身边工作入手，当好青少年的科学引路人，广泛开展科技教育活动，为提升青少年科学素质和培养科技创新后备人才奉献力量。