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永乐三年(1405年)中举，次年，进京会试，以进士副榜授官松江府儒学训导。奉命参与《永乐大典》的纂修。历太常博士、吏部考功员外郎、南京太常寺少卿、行在吏部左侍郎，曾多次奉命巡视畿甸蝗灾，询问民间疾苦。正统八年(1443年)改礼部左侍郎，魏骥以年老力衰请求致仕，遂改任南京吏部侍郎。正统十三年(1448年)，再以老辞官，不准。次年，又任南京吏部尚书。"土木之变"时，为对瓦剌用兵献计献策，屡被朝廷采纳施行。景泰元年(1450年)致仕。成化八年(1472年)卒，年九十八，赐谥"文靖"。

魏骥能诗文，有《南斋前后集》、《松江志》、《水利事实》、《水利切要》、《理学正义》、《南斋摘稿》等。