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2006年10月2日起，開始在廣播節目《[[GIRLS LOCKS]]》主持，和已畢業的[[戶田惠梨香]]是好友，曾與她一起送禮物給聽眾。2006年末，擔任日本格力高Pocky廣告代言人並參與廣播節目演出，其後人氣漸升[3]，並發行個人第一次的明星交換收藏卡（TRADING CARD），發售活動當天兩個場地約1300人到場，4400套完售，創下歷來第一次發行明星交換卡單日售出的最高紀錄。

2007年初，代言第85屆日本全國高校足球賽的應援經理，與第一任應援經理堀北真希皆為日本廣播節目《School of Locks》裡《Girls Locks》單元的主持人。另擔任2007年度的日本[[紅十字會]]勸導捐血代言人，原本每年代言人都是在該年度舉辦成年式，但新垣結衣與[[鈴木杏]]（2004年度）兩人卻是例外。2007年3月22日，推出第二本寫真集《純白18》，是以北國函館雪景與溫泉的背景來拍攝。2007年中，畢業於日出高等學校後未再升學，專注於演藝圈發展，並接演三部電影《戀愛部屋》、《暴走少年》、《戀空》；期間同時演出日9電視劇《父女變變變》。隨著首部主演電影《戀愛部屋》上映，同時擔任主題曲「追憶」的演唱者，之後，另演唱《戀空》的插曲「Heavenly Days」，皆未發行單曲。