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1956年，中国科学院古脊椎动物研究所古人类研究室华南洞穴调查队在着名[[人类学家]]裴文中教授率领下，到广西调查巨猿和人类化石时，在白莲洞土层中发现四件石器，1件扁尖的骨锥和1件粗制的骨针。这些石器均由砾石打制而成，石质为硅质灰岩和石英岩 <ref>[https://www.sohu.com/a/450494871_120870625 翡翠知识讲堂：染色石英岩与翡翠的区别有什么？]，搜狐，2021-02-11</ref> 。骨器针身和锥体已残破。后经鉴定，认为该洞庭湖的堆积属于“旧石器时代晚期”。1961年，柳州市政府将白莲洞列为市重点文物保护单位。该馆在裴文中教授倡议下，于1981年开始筹办白莲洞博物馆，同年5月1日裴文中为白莲洞题词：“中国可以成为[[世界]]上古人类学研究的中心，广西是中心的中心”。1985年春节期间，白莲洞博物馆正式开放，[[中央电视台]]、中央人民广播电台、《人民日报》等新闻媒体对外宣布了这一消息。同年2至5月，日本国家电视台、英国电视台、香港电视台先后派员来到白莲洞拍摄电视。

白莲洞博物馆因其丰富的古人类文化遗址内涵和洞内典型的岩溶地质现象而令中外[[专家]]、学者和游客瞩目。不少中外专家、学者在参观、考察白莲洞后均给予了高度评价。中科院院士，美国科学院外籍院士贾兰坡教授为白莲洞遗址发现40周年纪念题词为：“白莲清香泥不染，洞内堆积内涵多”。香港中文大学邓聪教授认为：“白莲洞遗址的发掘，完全解决了中国[[考古学]] <ref>[https://www.sohu.com/a/457153774_120968537 考古学专业大盘点] ，搜狐，2021-03-24</ref> 上中石器时代的长久不解之谜”。[[日本]]学者植原和郎和国际洞穴学会主席福特在考察白莲洞后，则分别得出了“日本人与柳江人同宗共祖”，“柳州是世界岩溶地形的心脏”的结论。白莲洞博物馆享誉海内外。