[[天顺]]元年(1457)正月，代宗病重，将军[[石亨]]和[[张軏]]密谋迎英宗复辟，徐有贞好功名，参与石亨和张軏的活动，辅助[[英宗]]复辟。[[天顺]]元年正月，授兵部尚书，三月，封武功伯兼华盖殿大学士(宰相)，掌文渊阁事。赐号奉天翊卫推诚宣力守正文臣，锦衣卫指挥使。 在英宗复位前，徐有贞一直感觉自己屈居于谦之下，政治抱负不得而展，因此与于谦结怨。英宗复辟后，徐有贞等就立即把于谦，王文等下狱。当时政局左右于皇权的归属。徐有贞诬陷于谦意欲迎立襄王世子，唆使百官上奏。英宗本来还无意杀掉于谦，回复说"谦实有功"，确实，于谦在土木堡之变中挽救了大明王朝，是个大大的功臣。徐有贞又说"不杀于谦，此举无名"，指复辟师出无名。英宗无奈，只好下令收押。狱中，有人说于谦谋反，查无实据。徐有贞答复说"虽无显迹，意有之"正是这句话，杀了一代忠臣，也成就了徐有贞的千古骂名。徐有贞的这句名言被后人提炼成了更加精练的两个字"意欲"成为足于秦桧杀岳飞的"莫须有"相提并论的冤案。

徐有贞久仰宜兴山水佳丽，尤其钟爱善权胜景。晚年受到削职处分回到吴县老家后，终于有暇，立即经三百里水路前来宜兴游览。先后游玩了善权洞景、善权寺庙及周围山清水秀的优美环境，连夜创作了《游善权寺二首》，又在宜兴会晤了老朋友，畅谈修缮善权寺事宜，并欣然答应善权寺修复大功告成后，一定作文记述。后来，善权寺修葺一新后，徐有贞得知该喜讯，随即撰写了《善权寺碑》，碑文一直留传至今。