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1987年，随[[学院]]院名的更改，学报亦于1988年随之更名为《潍坊医学院学报》，同时刊期改为季刊。
1991年，经国家科委同意，由[[国家新闻出版署]] <ref>[https://www.sohu.com/a/477908474_121123872 国家新闻出版署关于开展2021年度新闻出版单位高级职称评审工作的通知]，搜狐，2021-07-16</ref> 批准《潍坊医学院学报》为国内外公开发行的学术性期刊。
1997年起学报版式由小16开本（188mm×260mm），改为国际标准的大16开本（210mm×297mm）。
==收录情况==
《潍坊医学院学报》已加入[[清华大学]] <ref>[https://www.sohu.com/a/410629068_120628425？_f=index_betapagehotnews_5&_trans_=000019_hao123_pc 为什么说清华大学是中国大学的一面旗帜 ]，搜狐，2020-07-30</ref> 电子杂志社的光盘版，1990年加入天津《半导体杂志》社举办的联合征订，被《中文科技期刊数据库》和北京大学万方数据期刊上网组的数字化期刊收录。
==影响因子==