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杭州医学院共建有临床医学院、检验医学院、医学影像学 <ref>[https://www.sohu.com/a/129091584_508586 专业解读—医学影像学] ，搜狐，2017-03-16 </ref> 院、公共卫生学院、药学院、护理学院等6个二级学院以及基础医学部、通识教学部、社会科学部(马克思主义学院)、体育部、创新创业学院、继续教育学院，开设有12个普高专科专业，9个本科专业。

近年来我院教师主持课题50余项，其中“十一五”国家重点科技支撑项目1项,国家自然科学基金 <ref>[https://www.163.com/dy/article/G0MKVFME0511DCTQ.html 重磅！2021国家自然科学基金项目指南发布]，网易，2021-01-19</ref> 立项1项，省部级项目8项，承担了国家医师资格考试实践技能考试与考官培训基地（公卫类别）、浙江省基层卫生研究中心和浙江省学校卫生保健指导中心等相关工作，健康“微”文化志愿服务项目荣获中国红十字会总会志愿服务项目发展计划第五期二类项目资助。