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'''南方医科大学药学院'''是学校移交广东省后新组建的学院，下设 [[ 化学 ]] 系、药物化学系、药剂学系、药物分析学系、微生物与生化药学系、药理学系、药物研究所、临床药理研究所、实验中心和抗病毒研究中心。学院现有教师74名，其中67.6%具有博士学位，有 [[ 教 授10 授]]10 名， [[ 博士生导 师8 师]]8 名，初步形成了一支年轻有为、朝气蓬勃的师资队伍。

学院为博士、 [[ 硕士 ]] 和学士三级学位授权点医学教育|网搜集整理。其中，药理学专业为国家 [[ 教育 部1998 部]]1998 年批准为博士学位授权单位并在2007年批准为国家级重点学科。药物化学、药剂学和 [[ 药理学 ]] 三个专业为硕士学位授权单位。同时还设有药学本科专业，从2003年开始招收药学本科生。多年来，已经培养出一大批以博士生、硕士生为代表的优秀人才。

学院秉承“创新引领发展，特色成就卓越”的理念，以特色内涵建设、教学模式改革、多元协同创新发展以及体制机制创新“四位一体”的 [[ 改革 ]] 目标为使命，更新理念，整合资源，汇聚人才，为跻身中国高校最优秀的药学院行列而奋斗。

目前，学院设有8个创新群体，1个本科教学工作部，4个本科学系、9个 [[ 教学 ]] 团队、3个支撑中心。拥有药学一级学科博士后科研流动站，药学一级学科博士、硕士学位授权点，药学硕士专业学位授权点以及药学（四年制）和临床药学（五年制）两个本科专业。药学专业为广东省名牌特色专业，2019年获批国家首批一流本科专业建设点，2019年10月以新标准首家通过药学专业认证。临床药学专业于2020年获批国家级一流专业建设点。学院建有全国 [[ 药学 ]] 专业学位研究生培养示范基地、广东省高等学校药学化学实验教学示范中心、广东省药学化学虚拟仿真实验教学示范中心。现有国家药品监督管理局药物代谢研究与评价重点实验室、广东省新药筛选重点实验室、广东省药品监督管理局特殊人群药物代谢研究与评价重点实验室、广东省新药筛选国际联合实验室、广东省国际科技合作基地、广东省特殊膳食用食品研究生物医学创新平台、广东省保健食品新功能和安全性评价 [[ 工程技术 ]] 研究中心、广州市新发病毒防治药物研究重点实验室、药学实验中心和仿制药一致性评价中心等重点科研平台。

药学院现有正式在编人员103人，专任教师82人，以中青年教师为主体。其中：正高33人，副高37人，中级12人， [[ 研究生 ]] 导师53人，其中 [[ 博士生导 师28 师]]28 人，具有博士学位教师占专任教师总数90.2 %，具有留学背景的教师占比54.9 %。拥有国家杰出青年科学基金获得者2人，科技部“中青年科技创新”领军人才1人，“百千万人才工程”国家级人选2人，国家优秀青年科学基金获得者1人，国家重大人才工程青年学者1人，海外高层次人才2人，教育部“新世纪优秀人才”1人，享受政府特殊津贴者2人，“中国政府友谊奖”获得者1人，广东省医学领军人才1人，广东省“珠江学者”特聘教授1人，广东省“珠江学者”讲座教授2人，广东省“青年珠江学者”3人，南粤优秀教师3人，广东省特支计划“百千万工程”领军人才2人，广东省特支计划“百千万工程”青年拔尖人才2人，广东省“千百十工程”国家级培养对2人，广东省“千百十工程”省级培养对象2人，广东省“优秀青年教师培养计划”7人，广东省“珠江人才计划”青年拔尖人才2人， [[ 广州市 ]] “珠江科技新星”12人，学校教学名师5人，学校本科教学优秀教师2人，学校优秀教师11人。有多名教师在国内外 [[ 学术 ]] 团体任职，包括中国药理学会抗炎免疫药理专业委员会主任委员、中国药理学会临床药理专业委员会副主任委员、广东省药理学侯任理事长、教育部药学及化学类专业教学指导委员会委员等。

近五年来，学院先后承担了国家科技重大专项、 [[ 国家自然科学基金 ]] 区域创新发展联合基金重点支持项目、广东省“新药创制”科技重大专项、广东省重点领域研发计划等国家、省市级课题227项，研究经费1.68亿元。在Signal Transduct Tar、Angew Chem Int Ed、Adv Sci、Adv Materil、J Med Chem、Brit J Pharmacol等国际著名期刊上发表了SCI论文580余篇，申请和获得国家发明 [[ 专利 ]] 、国际PCT专利130余项，其中授权76项。获广东省药理学会科技成果奖二等奖1项。获省级教学成果奖二等奖1项。获省级以上教育研究项目19项。发表教学论文56篇。编写教材29部，其中主编、副主编11部。

2020年5月， [[ 化学 ]] 学科进入ESI全球排名前1 %。2020年11月，药理毒理学科进入ESI全球排名前0.25 %。