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<p style="text-indent: 30px; line-height:30px">依照國立臺灣大學組織規程規定，校長任期為四年，得續任兩次 <ref>[http://host.cc.ntu.edu.tw/sec/all_law/1/1-04.html 國立臺灣大學組織規程] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20120210030433/http://host.cc.ntu.edu.tw/sec/all_law/1/1-04.html |date=2012-02-10 }}</ref> 。2012年3月18日，李嗣涔教授於當天校務會議校長報告時宣佈他將不會競選連任下一任校長，在2013年6月21日任期屆滿卸任後將回電機系教書。<ref name="自由卸任">[http://www.libertytimes.com.tw/2012/new/mar/18/today-life4.htm?Slots=Life 李嗣涔不續任 臺大明年直選校長]</ref></p><p style="text-indent: 30px; line-height:30px">李嗣涔認為在他任內，[[國立臺灣大學]]在國際上的排名逐步提升，是他當校長最驕傲的成績，他也希望能在最後一年的任期，能帶領學校突破世界大學排名五十名 <ref>[http://news.chinatimes.com/politics/110101/112012031800133.html 無意續任 臺大校長遴選啟新局 李嗣涔：拚最後1年 推臺大進50大] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20120321024314/http://news.chinatimes.com/politics/110101/112012031800133.html |date=2012-03-21 }}</ref> 。李嗣涔在他主持的最後一次校慶典禮，84週年校慶上，期許在創校百年前臺大能出現本土的諾貝爾獎得主。<ref name="84聯合晚報">{{cite news |title=台大84年校慶 李嗣涔：盼台大養出本土諾貝爾 |date=2012-11-15 |work=聯合晚報 |author=游婉琪 |location=台北 |url=http://mag.udn.com/mag/campus/storypage.jsp?f_ART_ID=424529 |language=zh-tw |accessdate=2012-11-15 }}{{dead link|date=2018年3月 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref><ref name="84中央日報">{{cite news |title=台灣/李嗣涔盼台大出現本土諾獎得主 |work=中央日報 |date=2012-11-15 |author=閻光濤 |url=http://www.cdnews.com.tw/cdnews_site/docDetail.jsp?coluid=121&docid=102111032 |language=zh-tw |location=台北 |accessdate=2012-11-15 |archive-url=https://web.archive.org/web/20131101080702/http://www.cdnews.com.tw/cdnews_site/docDetail.jsp?coluid=121&docid=102111032 |archive-date=2013-11-01 |dead-url=yes }}</ref></p>