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学院现设药学系、制药工程系、[[生物工程]]系、生物医学工程系和中心实验室，开设有药学、制药工程、生物制药、[[生物医学工程]]<ref>[https://www.sohu.com/a/330659603_694348 生物？医学？不！我是“生物医学工程” ]，搜狐，2019-07-31 </ref>4个本科专业，构建了重庆市面向战略新兴产业的生物医药特色学科专业群。药学学科是重庆市十二五、十三五重点建设学科，生物医学工程为校级重点学科。学院现有生物医学工程、药学一级学科学术学位硕士点2个，生物医学工程、药学专业学位硕士点2个。

学院已同美国、英国、日本、[[澳大利亚]]、加拿大等国家有关著名[[大学]]、科研机构建立起良好的学术交流 <ref>[http://roll.sohu.com/20151225/n432613007.shtml 学术交流要回到“爱智慧”传统]，搜狐，2015-12-25</ref> 关系，正在积极建设3+1+1人才培养模式，增强国际联合办学能力。