2016年4月，有媒體質疑過去民進黨陳水扁主政時，御用律師顧立雄之妻王美花在一兩年間就由組長三級跳升到[[智慧財產局]]局長，指[[綠色執政]]更迭人事的手法直接，「喜歡」你就讓你上天堂，升遷三級跳。為此，智慧財產局特別發新聞稿澄清，該升遷「專業與經驗兼具」。
2016年7月，[[蔡英文]][[ 總統]] 上任後提拔王美花升任[[經濟部常務次長]]
2018年5月，爆發日本大創違法進口日本核災地區食品案，立委[[黃國昌]]爆料王美花一直找他關說此事，甚至要求「只要讓大創罰錢就好，不要撤銷進出口許可」