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1998年11月由广东省高教厅和[[国家]]中医药管理局批准广州中医药大学招收公共(卫生)事业管理[[本科]]专业，1999年4月挂牌正式成立了管理学院，并于同年9月开始招收首届公共事业（卫生）管理本科专业学生；2001年开办应用心理学成人大专，同年开始招收中医心理学研究[[方向]]的硕士[[研究生]]；2002年开设招收国际经济与贸易本科专业<ref>[https://www.dxsbb.com/news/1675.html https://www.dxsbb.com/news/1675.html国际经济与贸易专业就业方向与就业前景怎么样]，大学生必备网，2021-06-02</ref>；2003年学院更名为经济与管理学院，同年获得社会医学与卫生事业管理硕士学位授予权；2004年开始招收应用心理学本科专业。2005年10月学院整体搬迁到番禺区大学城校区，独立的经管楼建筑面积5000平方米，教学条件大为改善。2002年公共管理事业专业通过教育部本科教学评估；2006年国际经济与贸易专业通过广东省教育厅新专业建设评审；2007年应用心理学专业获得广东省中医药学会颁发的“学科建设突出贡献奖”，2008年应用心理学专业通过广东省教育厅新专业建设评审。目前该院在校学生总数已经达到1400多人，学院建设进入一个新的快速发展的阶段。