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石山圳目前分有舊進水口與新進水口。舊進水口位於台東大橋下方，進水量為每秒1.000C.M.S.，而因石山圳新進水口至舊進水口之間有兩條明渠圳路，雨後時常發生鄰近利吉惡地泥沙滑落至圳路之狀況，故舊進水口雖已無取水功能，但仍保留作為圳路[[淤積]]緊急排砂之功效。

卑南、石山二圳其進水口皆源自於卑南溪，因地勢 係由西向東傾斜，故河水均由西向東流注入太平洋。每年冬、春二季為乾燥無雨之枯水期，河川水量枯少 。而6至11月為颱風頻仍之豐水期，然因溪流坡度陡峻，河水易漲易退，如遇大雨山洪爆發，夾帶大量泥砂礫石沖毀擋水土堤及埋沒導水路且河床 刷深日劇，致使進水口取水工程施工日益困難，尤以石山圳進水口為甚，故轄區委員及小組長等對此問題相當重視，多次提案請求改善 ，經提報上級獲得重視，正積極提案規畫取水改善計畫中。