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马克思主义学院具有较长的发展历程。1995年至2000年设立社会科学系，承担全校公共政治理论课。2000年至2008年，单独设立为社会科学部。2008年11月，社会[[科学]]部更名为思想[[政治]]理论课教学部（简称“思政部”）。2015年4月，根据学校文件《关于成立马克思主义学院的通知》，思想政治理论课教学部更名为马克思主义学院，与政法学院实行一套人马、两个机构并行运作。2017年11月，马克思主义学院独立设置为学校二级机构。2018年4月，中共广东工业大学马克思主义学院总支部委员会成立。2018年5月，马克思主义学院正式独立运作。2020年3月，设置“马克思主义国家治理理论与政务管理”二级学科硕士点 <ref>[https://www.gdut.edu.cn/xkysz/xkjs1/ssxwsq.htm 广东工业大学硕士学位授权点]，广东工业大学</ref> 。

学院内设5个教研室：[[毛泽东思想]]和[[中国特色社会主义]]理论体系概论教研室、中国近现代史纲要教研室、马克思主义基本原理 <ref>[https://www.sohu.com/a/384211129_100643 马克思主义基本原理核心知识点梳理 （唯物论）]，搜狐，2020-03-30</ref> 教研室、思想道德修养与法律基础教研室、形势与政策教研室（军事理论教研室）。拥有广州市青年马克思主义理论人才培养研究重点基地、网络意识形态安全治理研究所、粤港澳大湾区科技战略与价值协同研究中心等研究机构。学院还与中共三大会址纪念馆等爱国主义教育基地共建“思想政治教育共建基地”、与学校图书馆共建马克思主义经典研读空间。