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学院现有河北省微生物学重点发展学科，[[遗传学]]、[[动物学]]、发酵工程、生态学4个校级重点学科，有河北省动物学实验教学示范中心、河北省湿地生态与保护重点实验室，建有省级衡水湖湿地—大学生校外实践教育基地，为学科教学（生物）和工程（发酵和环境）专业硕士点建设单位。2018年被东亚—澳大利西亚迁飞伙伴关系青头潜鸭工作组授予世界极危物种青头潜鸭衡水湖监测研究基地 <ref>[https://www.hsnc.edu.cn/info/1072/14675.htm 我校承办的青头潜鸭国际研讨会取得圆满成功]，衡水学院，2018-03-21</ref> 。

学院注重教学、科研、服务相结合，着重培养学生的实践技能和创新能力。建立了衡水湖[[国家]]级湿地和鸟类自然保护区、邓庄农业高新技术园区、[[河北省]]农科院旱作农业[[研究所]]、衡水老白干酿酒（集团）有限公司、衡水市园林管理局、烟台和青岛海滨、北京植物园等多个教学科研实践基地。依托衡水湖湿地保护区和衡水老白干酒业集团的地域资源优势，以培养应用型人才 <ref>[https://www.sohu.com/a/435733303_114731 面向未来的应用型、技术技能型人才如何培养 ]，搜狐，2020-12-02</ref> 、为地方经济服务为宗旨，认真修改、完善了人才培养方案，进一步整合教师学科研究方向，在引进高职称、高学历教师的同时，派出专业教师进驻企业进行科学研究，并聘请企业专家为兼职教授，努力打造强有力的教学科研团队。专业教师在衡水湖湿地保护和建设、微生物发酵以及高抗、优质农作物品种选育等方向进行了大量的研究工作，多项成果获国内领先或国内先进水平，数项成果获科技进步奖，有力地促进了地方[[经济]]的发展，进一步提高了[[教育教学]]质量，本科毕业生考研率达40%以上，“专接本”录取率名列河北省同类院校前茅；毕业生具有厚基础、宽口径、强能力、高素质的特点。多数毕业生工作在国内文教、卫生、防疫、环保、医药、酿造、食品、特种养殖业、自然保护区、园林、园艺等领域，普遍受到用人单位的好评。