该剧主要讲述了当代海军一批年轻的优秀舰长的成长轨迹，讴歌了和平时期海军官兵为维护祖国领土完整海洋权益做出的牺牲和奉献 <ref>[https://www.sohu.com/a/224234949_695175 旗舰：女兵给误伤战友道歉，得知战友放弃研究生过来当兵，超佩服]，搜狐，2018-02-27</ref> 。该剧已于2008年06月15日起在CCTV-1首播。

生不久的女儿托付给老战友郑冀一家照顾。郑冀驾测量船出海，因指挥失误导致工程师高明艳牺牲而刚刚出生的女儿也被偷走。为此，不久郑冀转业回乡。十几年后，郑冀的儿子郑远海为了实现父亲当年的愿望，大学毕业入伍来到海军东江基地。鲁淮成没有发觉郑远海就是郑冀的儿子，对才华横溢的他大加赞赏。为了改变郑远海狂傲的性格，出乎意料地安排他去猪场喂猪，郑远海大发其火。在鲁淮成的安排下郑远海报考了舰艇学院研究生。郑远海也终因性格莽撞又一次付出代价，在八号海域差一点导致军舰触礁。走向成熟的郑远海从国外学成归来，几年后成长为一名护卫舰舰长。鲁淮成退休了，在女儿梅杏儿的陪伴下来为即将率队出访的郑远海送行，在郑远海指挥的旗舰带领下，特混编队消失在海平线上，留下了一条永不消逝的航迹 。 <ref>[3https://www.tvmao.com/drama/VyxqVg==/ 旗舰剧情介绍(1-34全集)大结局_电视剧] ，电视猫</ref>。