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广东省渔业生态环境重点开放实验室针对我省渔业生态环境面临的关键科学技术问题，加强我省渔业生态环境应用基础研究和高新技术研究；立足国内外学科发展前沿，综合应用各相关学科高新技术，多角度、多层次地开展渔业生态环境、生物多样性、珍稀水生生物保护、环境污染效应、及环境污染调控的基础研究、应用基础研究和应用技术研究，为实现我省渔业生态环境良性循环、渔业资源和渔业生产的可持续发展提供科学保证。