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超声医学工程国家重点实验室，前身是1988年创建的重庆医科大学超声生物学效应研究课题组，距今已有32年的发展历史。实验室（重庆市科技局主管）依托重庆医科大学，于2020年3月3日由科技部和重庆市人民政府批准建设运行。 实验室以领先国际的超声治疗技术为主线，围绕强声学与声学效应、多模态影像监控与智能精准治疗、超声治疗临床研究与大数据三个研究方向，瞄准世界科技前沿，面向国家战略与地方经济社会需求，成功搭建了以超声治疗为代表的微无创医学学术和技术平台。
实验室科研用地面积约4500m2，固定资产总值约6000余万元。实验室现有人员60余名，拥有国家杰出青年科学基金获得者2名，长江学者1名，国家973计划<ref>[[973 http://www.china.com.cn/guoqing/2014-09/02/content_33407148.htm 什么是973 计划 的定位与申请]？] ，2009，中国网，2014-0609-1102</ref>首席科学家1名，国家重大科研仪器设备研制专项获得者2名，国家“百千万人才工程”获得者2名，全国杰出专业技术人才2名，教育部跨世纪（新世纪）人才支持计划获得者2名等。在长期的发展过程中，实验室已经自然形成了一支具有高水平、多学科交叉的科研团队，并于2004年获评教育部“长江学者和创新团队发展计划”的生物医学超声创新团队。
近年来，实验室作为首席单位先后承担了国家重大仪器专项1项、国家973计划项目1项、国家“十二五”科技支撑计划1项、国家“十一五”科技支撑计划2项、国家自然科学基金委重点项目3项、杰出青年基金项目1项等100余项国家和地方科研项目，获准科研经费1亿余元。已获2010年国家科技进步二等奖1项、2000年国家技术发明二等奖1项等多项荣誉；在国内外刊物上公开发表学术论文1000余篇，其中SCI论文上近300篇；出版《微无创医学丛书——子宫肌瘤》、《医学仪器原理及应用》、《实用超声治疗学》、《超声治疗学》、《超声医学》等专著。