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（二）负责流域水资源的管理和监督，统筹协调流域[[生活]]、[[生产]]和生态用水。组织开展流域水资源调查评价工作，按规定开展流域水能资源调查评价工作。按照规定和授权，组织拟订流域内省际水量分配方案和流域年度水资源调度计划以及旱情紧急情况下的水量调度预案并组织实施，组织开展流域取水许可总量控制工作，组织实施流域取水许可和水资源论证等制度，按规定组织开展流域和流域重要水工程的[[水资源]]调度。
（三）负责流域水资源保护工作。组织编制流域水资源保护规划，组织拟订跨省（自治区、直辖市）江湖湖泊的水功能区划并监督实施，核定水域纳污能力，提出限制排污总量意见，负责授权范围内入河排污口设置的审查许可；负责省界水体、重要水功能区和重要入河排污口水质状况监测；指导协调流域[[饮用水]]水源保护、[[地下水]]开发利用和保护工作 <ref>[https://www.sohu.com/a/231330268_162758 保护地下水资源 防控治理刻不容缓 ]，搜狐，2018-05-12</ref> 。组织开展[[太湖]]流域水环境综合治理有关工作。指导流域内地方节约用水和节水型社会建设有关工作。
（四）负责防治流域内的水旱灾害，承担流域防汛抗旱总指挥的具体工作。组织、协调、监督、指导流域防汛抗旱工作，指导、协调并监督防御[[台风]]工作。按照规定和授权对重要的水工程实施防汛抗旱调度和应急水量调度。组织实施流域防洪论证制度。组织制定流域防御[[洪水]]方案并监督实施。指导、监督流域内蓄滞洪区的管理和运用补偿工作。按规定组织、协调水利突发公共事件的应急管理工作。
（九）按规定指导流域内农村水利及农村水能资源开发有关工作。负责开展水利[[科技]]、外事和质量技术监督工作。承担有关水利[[统计]]工作。
（十）按照规定或授权负责流域控制性水利工程、跨省（自治区、直辖市）水利工程等中央水利工程的[[国有资产]] <ref>[https://www.sohu.com/a/296098598_120094116 国有资产处置如何保值增值？这些政策法规不可不知 ]，搜狐，2019-02-21</ref> 的运营或监督管理；研究提出直管工程和流域内跨省（自治区、直辖市）水利工程供水[[价格]]及其直管工程上网电价核定与调整的建议。
（十一）承办水利部交办的其他事项。