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中国科学院昆明动物研究所围绕“一三五”发展规划，确定了立足西南及[[东南亚]]丰富的[[生物]]多样性 <ref>[https://iask.sina.com.cn/b/6i3UdIHNWUP.html 什么是生物多样性？ ]，爱问</ref> 资源，凝练了“重大疾病灵长类新型动物模型创制与新药研究”、“基因组进化的理论突破”、“家养动物及其野生近缘种基因资源发掘”等三个重点突破方向。

截至2014年底，昆明动物所共有在职职工425人。其中科技人员182人、科技支撑人员190人，包括[[中国科学院院士]]1人、发展中国家科学院院士1人、研究员及正高级工程技术人员34人、副研究员及高级工程技术人员53人。共有“西部之光”人才入选者91人（新增9人）；[[国家杰出青年科学基金]] <ref>[http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/xmzn/2020/08/ 国家杰出青年科学基金项目]，国家自然科学基金委员会</ref> 获得者10人。