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该寺于[[北宋]]嘉祐元年（1056）由阿底峡弟子、[[噶当派]]创始人仲敦巴（1005－1064）创建；为噶当派的第一座寺院 <ref>[https://www.sohu.com/a/18784481_116154 西藏：走进千年古寺—热振寺 ]，搜狐，2015-06-14 </ref> 。15世纪初叶，改宗格鲁派，属色拉寺结巴扎仓。主要[[建筑]]有措钦大殿、热振拉让等。阿底峡大师的银铸灵塔也在此寺。清[[乾隆]]年间，[[七世达赖]]的经师阿旺曲登任寺堪布，即为热振一系之祖。二世洛桑盖敦巴受封为“诺门军”。三世阿旺益西粗赤坚赞曾两度任摄政。五世热振呼图克图丹绛巴·益西丹巴坚赞在十三世达赖逝世后，任摄政和十四达赖丹增嘉措的经师。寺已毁，现仅存[[遗址]]。