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长沙市审计局内设14个职能处(室)：办公室、法制处、财政审计处、[[金融]]与[[社会保障]]审计处、行政事业审计处、经贸审计处、[[农业]]与资源环保审计处、政府投资审计专业局 <ref>[http://sjj.changsha.gov.cn/zfxxgk/fdzdgknr/jgjj/nsjg/ 长沙市审计局-内设机构 ]，长沙市审计局，2020-05-25 </ref> 、外资运用审计处、经济责任审计局、人事教育处、机关党委、计算机管理处、内部审计指导处。

长沙市审计局主要职责是：1、贯彻执行国家关于审计工作的方针、政策，根据上级审计机关的部署，结合长沙的实际，研究拟订长沙审计工作的方针、政策，制定审计业务规章制度和工作规划；组织行业和专项资金的审计或审计调查；组织领导、协调监督全市各级审计机关的业务。2、向市人民政府报告和向市人民政府有关部门通报审计情况，提出制定和完善有关政策法规、[[宏观调控]]措施的建议。3、根据《[[中华人民共和国审计法]]》 <ref>[https://www.sohu.com/a/260141481_205685 【法律快递】中华人民共和国审计法 ]，搜狐，2018-10-17 </ref> 的规定，直接审计：市本级财政预算执行情况和其他财政收支；区、县（市）人民政府预算执行情况和决算；市属国有企业及地方金融机构的资产、负债和损益情况；市人民政府部门管理的和受市人民政府委托由社会团体管理的[[社会保障基金]]、环境保护基金、社会捐赠资金及其它有关基金、资金的收支情况；市人民政府接收到国际组织和外国政府援助、贷款项目以及赠款项目的财务收支；市直各部门、事业单位及其下属单位的财务收支和专用资金使用情况；市人民政府及市直各部门基本建设项目概预算执行和决算；根据《中华人民共和国审计法》和地方人民政府授权，审计集体经济组织资产、负债和损益。4、受市委、市人民政府委托，组织全市审计机关依法对党政领导干部和[[国有企业]]负责人进行任期经济责任审计；依法受理被审计单位对下级审计机关审计决定的复议申请。5、组织实施对全市内部审计工作的指导和监督；组织专业培训。6、与区、县(市)人民政府共同领导区、县(市)审计机关，协同办理区、县(市)审计机关负责人的任免事项；7、承办市委、市政府和上级机关交办的其他事项。