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魏森堡号受到镍钢克虏伯装甲的保护，这是一种强度更大的新型钢材。其装甲带在中央部分的厚度达400毫米（16英寸），用于保护弹药舱及轮机舱。甲板装甲的厚度为60毫米（2.4英寸）。而主炮塔的炮座则以300毫米（12英寸）厚的的装甲板覆盖。