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围绕旅顺博物馆藏文物开展综合性科学研究，是旅顺博物馆] </ref> 学术规划的重要内容。<ref>[http://www.china.com.cn/book/zhuanti/1bowuguan/2008-10/22/content_16650329.htm 旅顺博物馆] </ref> 旅顺博物馆与海内外学术机构进行了广泛的交流与合作，举办了旅顺博物馆藏佛经残片国际学术研讨会，唐鸿胪井石刻国际学术研讨会等国际学术会议。出版了《旅顺博物馆藏佛经研究论文集》、《旅顺博物馆藏汉文佛经残片选》、《西域出土梵文佛经残片》、《旅顺博物馆藏新疆出土文物研究文集》、《旅顺博物馆》、《旅顺博物馆藏画选》、《旅顺博物馆藏铜镜》、《旅顺历史与文物》、《清孙温绘红楼梦图册》《旅顺博物馆精品文物选粹系列丛书》《旅顺博物馆95年简史》等多部著作，馆内业务人员发表考古报告及学术论文达数百篇。为了加强人才培养、推动学术研究，大连市文化广播影视局还在旅顺博物馆的基础上，成立了大连市历史文物研究所。旅顺博物馆已经与[[日本]]、[[韩国]]、朝鲜、[[俄罗斯]]等国外多所文博单位、科研院所开展合作，从多学科、多角度对馆藏文物进行深入研究。博物馆拥有丰富的藏品资源，以藏品为基础开展学术研究活动，是博物馆一直坚持的原则。馆内现有专业人员30多人，其中正、副研究员9人，这些人都具有丰富的工作经验和扎实的业务研究能力。馆内非常重视专业人员的学术研究及创新活动，鼓励他们多出成果、出好成果，并通过举办展览、出版专著等形式展示他们的学术成果。博物馆还连续多年与国内外的学术机构及团体进行学术交流与合作，并取得可喜成绩。2012年5月，旅顺博物馆启动了国家社科基金项目《旅顺博物馆馆藏殷墟甲骨文的整理与研究》。