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'''澎湖寨巡检司'''，或称澎湖巡检司，设置于[[澎湖群岛]]。设治时间以1281年（元世祖至元十八年）的考证最为早，也就是根据一般史书及《[[元史]]》、《[[新元史]]》，考定：“蒙元世祖远征日本因风失败，迂回台湾，道经澎湖设治澎湖，企图进取台湾，作为征日本之准备。”该地方区划隶属于元朝福建行省泉州府，主官为澎湖寨巡检。[[明朝]]击败元朝取得中原政权后，仍依循前例于澎湖设置该官署，直至1384年因为实施封海政策，予以废除。1563年，考量沿海治安等因素，明朝复设澎湖寨巡检司。此官署直至1622年，荷兰占领澎湖为止。