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跟北约不同的是，东南亚条约组织并未设立一支接受统一指挥的军队。另外，虽然美国在组织内的成员资格为其在越南战争（1955年至1975年）期间大举干涉印度支那地区的军事提供了理据，但组织本身的响应协议（协议的内容把共产主义视为成员国的“共同威胁”）对成员国而言却模糊无效。