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大芦花景区具有典型的变质核杂岩地质特征，在中侏罗世一[[白垩纪]]<ref>[https://ask.game234.com/q/26974392.html 侏罗世 白垩世是什么?]，234游戏网，2019-07-26</ref>的中新生代剧烈岩浆活动，花岗岩侵位，破坏古老结晶基底，使其糜棱岩化，在花岗岩顶起、突破结晶基底过程中，与周围岩石之间产生剪切作用形成医巫闾山变质核杂岩。在变质核杂岩形成同期或晚期，在该地区明显发育NNE向正断层和NW向平移断层，破坏了侵入的花岗岩体和盖层小牵马岭片麻岩等组成的变质核杂岩，形成大型断层崖和崇山峻岭，造就了大[[大芦花风景区|芦花景区]]俊美壮丽的地质遗迹景观。

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