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本站与位于飞沙角站旁的的南沙停车场接轨 <ref>[https://gz.focus.cn/loupan/24341/dongtai/6948180.html 【南沙城】毗邻地铁4号线的蕉门站和金洲站]，搜狐焦点</ref> 。

本站西端和东端均设有单渡线，在本站启用后至2017年10月9日，所有4号线列车均使用车站西端的单渡线进行站前折返，列车抵达北面1号月台后同时完成上下客的过程；而2号月台及可供列车站后折返东端的单渡线均较少机会使用，只会在突发情况下才会使用。2017年10月10日开始，4号线 <ref>[http://wenda.bendibao.com/live/201985/46662.shtm 广州金洲地铁站几号线]，本地宝，2019-08-05</ref> 与即将开通的南延段进行贯通试运营，故所有列车均在2号月台清客，然后驶入南延段进行测试，并在南沙客运港站折返，再驶回本站1号月台后开始载客。