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原柳州铁路运输中级法院办公地点为[[柳州市]]柳南区城站路183号。2007年11月16日，柳州铁路局更名为南宁铁路局并迁往南宁 <ref>[http://www.gov.cn/gzdt/2007-11/16/content_807497.htm 铁道部批复柳州铁路局自16日起更名为南宁铁路局]，中国政府网， 2007-11-16 </ref> 。同日，柳州铁路运输中级法院更名为南宁铁路运输中级法院。该院是应随南宁铁路局搬迁的单位，但因为在南宁没有办公地点，所以该院仍在柳州的原址异地办公。2009年7月8日，中央下发了中央编办发〔2009〕15号《关于铁路公检法管理体制改革和核定政法专项编制的通知》，明确了南宁铁路运输中级法院所在地位于南宁市。后来，[[南宁铁路局]]在南宁市明秀西路57号（原宁铁物流总公司所在地）为南宁铁路运输中级法院提供了在南宁市的临时办公用房。2011年12月6日，南宁铁路运输中级法院南宁临时办公点在明秀西路57号正式挂牌办公。2015年12月22日，座落于南宁市青秀区吉祥路19号的新审判综合大楼正式启用 <ref>[http://sjztlys.hebeicourt.gov.cn/public/detail.php?id=690 南宁中院新审判综合大楼正式启用]，石家庄铁路运输法院网，2016-11-3 </ref> 。