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1934年，国立中央研究院自然历史博物馆改名为“国立中央研究院动植物研究所”。[[抗日战争]]期间，动植物研究所多次迁址，自南京而至[[湖南]][[衡阳]]、再至广西[[阳朔]]，终定于[[四川]]北培。1944年，动植物研究所分建动物研究所和植物研究所，罗宗洛出任植物研究所所长。究其原因，动植物研究所内植物研究人员占比不足三分之一，而所长[[王家楫]]是[[动物学家]]，因此植物研究不受重视。

[[中国共产党]]取得政权后，植物研究所分拆参与组建中国科学院实验生物研究所和中国科学院水生生物研究所。1953年，实验生物研究所植物生理研究室和昆虫研究室分别独立为中国科学院植物生理研究所和中国科学院[[昆虫]]研究所，发生生理研究室继续沿用实验生物研究所的名称。1959年，中国科学院昆虫研究所上海工作站调整为中国科学院上海应用昆虫研究所，1962年改名为中国科学院华东昆虫研究所，1978年定名中国科学院上海昆虫研究所。