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戴云山于2005年8月9日被列为[[国家级自然保护区]] <ref>[http://jingguan.yuanlin.com/scene/protect/2008-1-14/7123.html 戴云山国家级自然保护区]，中国园林网，2008-1-14 </ref> ，保护区设有戴云山保护区管理局。

戴云山是一座天然的绿色宝库。孕育有维管束植物145科393属580种。有些地方尚保存着成片的半原始森林，有[[鹅掌楸]]、黄檀、油杉、福建柏、建宁椴、红豆树、东方古柯等国家珍稀林木和樟、楠、栎、[[黄山松]]等福建乡土珍贵树种 <ref>[http://www.mnw.cn/quanzhou/dehua/xw/1926832.html 戴云山黄山松群落 为中国最大的黄山松种质基因基地]，闽南网，2018-1-21 </ref> 。另有山茶花、兰花、杜鹃、百合、[[卷丹]]、野牡丹等多种花卉。此外，还有石菇、石绥、瑞香、[[黄连]]、香薷、银耳、[[金线莲]]、银线莲和夜明砂等60多种中药材，以及茅膏菜、圆叶茅膏菜、黄花狸藻、挖耳草等有趣的食虫植物。旅游者在观光浏览的过程中，体验壮丽秀美的自然风光、感受回归大自然愉悦心情的同时，进一步激发他们热爱森林、保护自然的美好情愫，在这里您还可挖掘出丰富的[[森林]]文化、花文化、竹文化、茶文化等文化内涵。