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菏泽学院获批国家级建设园区“山东菏泽国家农村产业融合发展示范园”（合作），拥有山东省重点学科3个、工程实验室1个、工程技术研究中心1个、非物质文化遗产研究基地1个、中华优秀传统文化传承基地1个、人才培养模式创新实验区1个、实验教学示范中心1个，山东省高等学校重点实验室1个、人文社科研究基地1个、对接产业类协同创新中心1个，山东省高水平应用型专业群5个、[[特色专业]]6个、卓工计划专业2个、专业综合改革试点项目1个，山东省[[精品课程]]22门、双语教学示范课程1门。

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