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学校起步于1946年7月东北银行总行举办的[[银行]]干部训练班。经历了东北银行干部学校、东北银行专门学校、长春银行学校、吉林财贸学院、吉林省财贸学校等几个历史时期；1978年5月恢复吉林财贸学院；1992年5月更名为长春税务学院；2010年3月更名为吉林财经大学 <ref>[https://www.gaodun.com/zhuanti/jlcj/ 吉林财经大学_录取分数线_招生条件_就业情况]，高顿网校</ref> 。

截至2014年5月，学校有32个本科专业，其中[[国家级特色专业]]6个，[[省级特色专业]]10个 <ref>[http://www.help315.com.cn/gkdt/2020/0323/5650.html 吉林财经大学是一本还是二本？王牌专业推荐录取分数线是多少？]，考试帮手网，2020-03-23</ref> ；有国家级精品课程1门，省级精品课程29门；有国家级优秀教学团队1个，省级优秀教学团队10个；有省级实验教学示范中心4个。学校为全国首批卓越法律人才教育培养基地，2012年注册会计师专业方向在中注协教学评估中进入A级行列，与中央财经大学、天津财经大学位列前三名。2014年在第八届中国[[MBA]]领袖年会上，亚泰工商管理学院荣获“中国十佳MBA商学院”荣誉称号。