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2000年北京大学与[[北京医科大学]]合并，原北京医科大学图书馆改称北京大学医学图书馆。
2005年对1975年旧馆大修，整合了新旧两馆。新旧馆总面积超过51,000平方米，阅览座位4000多个，藏书容量可达650万册，规模上成为[[亚洲]]高校第一大馆 <ref>[https://bbs.pku.edu.cn/v2/collection-read.php?path=groups%2FGROUP_1%2FPKUdevelopment%2FD5CB3CCDC%2FM.1034681066.A 亚洲高校第一大馆－北大图书馆将迎来百周]，北大未名</ref> 。
北京大学图书馆馆藏图书现已达近800万册（件），居国内高校图书馆之首，现收藏中文现刊4045种，外文现刊3167种，中外文全文电子期刊达14000余种，[[光盘]]及[[网络]]数据库260个。现有古籍150万册，其中善本书17万册，珍稀品种和版本数千种，在全国图书馆中居第三位。现藏金石拓片24000种，56000份，绝大部分是[[石刻]][[文字]]拓片，其数量居中国前列，[[中国]]高校之首。
==馆藏撷珍==
截至2015年底，总、分馆文献资源累积量约1100余万册（件）。其中纸质藏书800余万册，以及近年来大量引进和自建的中国国内外[[数字]]资源，包括各类数据库、[[电子]]期刊、[[电子图书]]和[[多媒体]]资源约300余万册（件）。馆藏中有150万册中文古籍，其中20万件5至18世纪的珍贵书籍，是[[中华民族]]的[[文化]]瑰宝，被[[国务院]]批准为首批[[全国古籍重点保护单位|国家重点古籍保护单位]] <ref>[http://pkunews.pku.edu.cn/xwzh/2008-10/30/content_131348.htm 北大图书馆被国务院命名为“全国重点古籍保护单位”]，北京大学新闻网，2008-10-30</ref> 。外文善本、金石拓片、1949年前出版物的收藏均名列中国国内图书馆前茅，为研究家所珍视。此外，还有燕京大学学位论文、名人捐赠等特色收藏。
==视频==