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东北林业大学是在浙江大学农学院森林系和东北农学院森林系基础上建立的，由原国家林业部直属管理。2000年3月，由国家林业局划归教育部直属管理。2010年11月教育部和国家林业局签署协议、2012年3月教育部与黑龙江省人民政府签署协议，合作共建东北林业大学 <ref>[http://www.edu.cn/ke_yan_yu_fa_zhan/gao_xiao_cheng_guo/gao_xiao_zi_xun/201203/t20120305_747965.shtml 教育部与黑龙江省签协议共建东北林业大学]，中国教育和科研计算机网，2012-03-05</ref> 。

截至2018年3月，学校有9个[[博士后]]科研流动站，1个博士后科研工作站，8个一级学科博士点、38个二级学科[[博士]]点，22个一级学科硕士点、95个二级学科硕士点、11个种类32个领域的专业学位硕士点；2个世界一流学科建设学科 <ref>[https://www.dxsbb.com/news/60303.html 东北林业大学重点学科专业有哪些？]，大学生必备网，2019-8-28</ref> ，3个一级学科国家重点学科，11个二级学科国家重点学科，6个国家林业局重点学科，2个国家林业局重点（培育）学科，1个黑龙江省重点学科群，7个黑龙江省重点一级学科。