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三菱日联银行的前身之一东京银行在1958年与[[中国银行]]签订了中日间的代理行协议，这是第一份中日间外汇交易合作协议。1980年2月，原东京银行开设北京代表处，成为首家在[[北京]]开设代表处的外资[[商业银行]]。1982年和1984年，该行又分别开设了上海代表处（首家日资商业银行）和[[广州]]代表处、[[大连市|大连]]代表处（首家外资商业银行）。1986年，原东京银行开设深圳分行，成为首家在[[深圳]]开设分行的日资银行。此后，该行又陆续在中国境内开设多处代表处并将部分代表处率先升格为分行。

2007年7月，三菱东京日联银行（中国）有限公司在[[上海]]成立，三菱东京日联银行在[[中国大陆]]的分支机构均转移到该公司旗下。2008年11月14日，标准普尔评级[[服务]]宣布授予三菱东京日联银行（中国）有限公司“A+”和“A-1”的长期和短期交易对手信用评级，评级展望稳定。2009年12月，三菱东京日联银行（中国）有限公司获得了在银行同业间债券市场上发行以人民币计价的[[债券]]的许可，成为首家获准在中国境内发行人民币债券的外资商业银行。