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但由於釧路川下游的濕地地區經常發生泛濫，1890年的水利工程決定將阿寒川從山花地區興建一條6.24公里長的分水溝，將部分河水接入大樂毛川。1914年開始，為了解決釧路港因釧路川帶來的 [[ 淤積 ]][[ 河沙 ]] ，將阿寒川從現在的昭和町地區改往南直接住入太平洋，並與釧路川分開，新的這段河道則命名為「阿寒新川」。<ref name="河川局">{{Cite web| url=http://www.mlit.go.jp/river/shinngikai_blog/shaseishin/kasenbunkakai/shouiinkai/kihonhoushin/060711/pdf/ref5-1.pdf| format=PDF| publisher=國土交通省河川局| title=釧路川水系流域及河川的概要| date=2006-07-11| language=ja| accessdate=2016-02-24}}</ref><ref name="地質學會">{{Cite web| url=http://www.geosites-hokkaido.org/geosites/site0630.html| title=阿寒川的舊河道| work=北海道地質百選| publisher=日本地質學匯北海道支部| accessdate=2016-02-24| language=ja| author=石井正之}}</ref><ref name="ganbo">{{Cite book| title=釧路濕原導覽（日文原名：釧路湿原ガイド）| author=ganbo| url=http://p.booklog.jp/book/20118| accessdate=2016-02-24| language=ja| publisher=株式会社ブクログ}}</ref>

在1920年8月10日的一場大雨帶來的 [[ 洪水 ]] 造成原本在山花地區興建的分水溝損壞，使得阿寒川全數都經由大樂毛川直接流入太平洋，因此阿寒川和阿寒新川完全分離成為兩條河川。之後在1930年釧路川的水利工程，將新阿寒川出海一段改為釧路川新的河道，變成為「新釧路川」的一部分，而其餘河道則成為仁仁志別川。<ref name="河川局"/><ref name="地質學會"/><ref name="ganbo"/>