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棘阿米巴原蟲所引起的角膜炎，雖然在角膜炎中屬於較罕見的感染，但在診斷及治療上卻頗為棘手，而且有可能導致失明。棘阿米巴原蟲主要生活在土壤及水中，在污水系統、冷卻水塔、冷暖空調系統也能找得到，在人體中，主要會造成中樞神經及角膜的感染。由棘阿米巴原蟲所引起的角膜炎，有80％至85％（另一說是70％）是隱形眼鏡配戴者（軟式隱形眼鏡中獎機率較高，不過，最近發現角膜塑型片相關的角膜潰瘍也有不少是由棘阿米巴原蟲所引起的）。尤其是那些未好好清理、清潔隱形眼鏡的人（如用 [[ 自來水 ]] 沖洗隱形眼鏡）、戴著隱形眼鏡游泳、洗澡，或是角膜有外傷，接觸污水者，更有可能得到棘阿米巴角膜炎。