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衛福部疾管署(時為衛生署疾管局)2011年4月26日公布國內首例感染棘狀阿米巴原蟲引起腦炎個案，患者為一名63歲男子，在田中跌倒，嗆入髒水，所幸醫師警覺性高，及早用藥，患者在住院78天後康復出院，僅留下語言略微遲緩的後遺症。疾管局研究檢驗中心寄生蟲實驗室副研究員嵇達德指出，這名男子住在中部，退休後，在住家旁田地種稻，2008年底不慎跌落在田溝中，並兩度嗆入髒水，10天後出現低度發燒、頭痛、腹脹、排尿困難、便秘等症狀。兩週後男子到彰化基督教醫院就醫，被收治住院，但仍有間歇性發燒、頭痛加劇、肌躍症等神經學症狀，之後意識不清。檢查發現，腦脊髓液中的嗜伊紅性白血球增加，與阿米巴狀的單細胞現象，醫師懷疑是阿米巴性腦炎，緊急使用抗寄生蟲藥物與類固醇藥物，並聯絡疾管局，經檢驗確認為感染棘狀阿米巴原蟲，轉至台大醫院治療，男子住院78天後康復出院 <ref>[https://news.ltn.com.tw/news/life/paper/487876 圖片來源:感染阿米巴原蟲 老農治療康復]自由時報</ref> 。

疾管局後續在男子跌倒的田中也培養出棘狀阿米巴原蟲，這與引發「阿米巴痢疾」的痢疾阿米巴原蟲，分屬不同種類的阿米巴原蟲。棘狀阿米巴原蟲引起的腦炎，死亡率高達8到9成，這名男子因主治醫師警覺性高，及早用藥，康復後僅有語言反應略微遲緩，該報告去年8月已發表在「美國熱帶醫學與衛生期刊」。時任疾管局副局長周志浩提醒，民眾皮膚若有傷口，應避免接觸髒水；至於游泳池、溫泉、SPA等娛樂用水，在殺菌消毒不完全的情況下，也可能會有阿米巴原蟲。醫師若發現病患有類似症狀，也應懷疑此病的可能性 ，由於病患住院期間得到完善治療幸運康復出院 。