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薩本棟出身于著名的 [[ 福州]][[色目人]]薩氏家族，因為先祖曾經世居[[雁門]]，故常稱為[[雁門薩氏]]。[[元代]]末期，其中一支後人遷居福州，名列福州八大家族。幼時熟讀四書五經，稍長接受現代教育，1921年畢業於清華學校 ([[清華大學]]前身)，1922年赴[[美國]]留學，1924年畢業於[[史丹福大學]]機械系，1927年獲得[[麻省]][[伍斯特理工學院]]博士學位。1928年回國擔任母校[[清華大學]]物理系教授，1937年至1945年擔任改为国立后的第一任[[廈門大學]]校長<ref name="香港福州同鄉會">[https://web.archive.org/web/20021116013414/http://hk.geocities.com/fuzhou88hk/E/E9.htm 香港福州十邑同鄉會 故鄉人杰 薩本棟]</ref>。   时值 [[ 日本 ]] 侵略 [[ 中国 ]] ，地处沿海的 [[ 厦门大学 ]] 受到战火波及。萨本栋带领厦门大学师生西迁闽西长汀，艰苦办学，培养出了众多优秀人才。萨本栋领导下的厦门大学被誉为“加尔各答以东第一大学”，达到了一个空前的高度 。1935 。 1935 年赴美擔任[[俄亥俄州立大學]]客座教授<ref>[http://www.pep.com.cn/czwl/xszx/ptlx/200406/t20040621_90353.htm 人民教育出版社 物理學家 薩本棟]{{dead link|date=2018年4月 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref>，1945年返國擔任[[中央研究院]]總幹事。  [[ 国民党 ]] 六大召开前夕，列入 [[ 朱家骅 ]] 与 [[ 陈立夫 ]] 联名向 [[ 蒋介石 ]] 推荐的98名“最优秀教授党员”之一<ref>[http://news.ifeng.com/history/zhongguojindaishi/detail_2013_04/16/24258575_0.shtml 45年国民党“最优秀教授党员”：华罗庚陈寅恪冯友兰]</ref>。