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<small>[https://zhuanlan.zhihu.com/p/103524405?utm_source=qq 知乎]</small>
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'''[[2019新型冠状病毒]]'''(2019-nCoV),因2019年[[武汉]]病毒性肺炎病例而被发现<ref>[http://www.chinadevelopment.com.cn/sh/2020/0115/1601245.shtml 武汉市卫健委通报:1月13日无新增新型冠状病毒感染的肺炎病例],中国发展网,2020-01-15</ref>,2020年1月12日被[[世界卫生组]]织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族,已知可引起感冒以及[[中东呼吸综合征]](MERS)和[[严重急性呼吸综合征]](SARS)等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株。
2019年12月以来,湖北省武汉市持续开展流感及相关疾病监测,发现多起病毒性肺炎病例,均诊断为病毒性肺炎/肺部感染。<ref>[http://m.news.cctv.com/2019/12/31/ARTIL1JxT1xYZ9uMgxwJRDmJ191231.shtml 武汉12月发现病毒性肺炎病例27例 大部分为海鲜城经营户],CCTV,2019-12-31</ref>
人感染了冠状病毒后常见体征有呼吸道症状、发热、咳嗽、气促和呼吸困难等。在较严重病例中,感染可导致肺炎、严重急性呼吸综合征、肾衰竭,甚至死亡。目前对于新型冠状病毒所致疾病没有特异治疗方法。但许多症状是可以处理的,因此需根据患者临床情况进行治疗。此外,对感染者的辅助护理可能非常有效。<ref>[https://mp.weixin.qq.com/s/Du_243oMplFskyNgpaU2aA 关于新型冠状病毒感染的肺炎,你应该了解!],微信公众账号 联合国,2020-1-21</ref>
==基因团伙==
冠状,指病毒的独特形状,作为一种大型病毒家族,冠状病毒常见于哺乳类和鸟类中。
与动植物基因组相比,2019新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组实在太简约,但并不简单。那么,2019-nCoV基因组中的这几个基因又是怎样“朋比为奸”的?
2019-nCoV基因组简约但并不简单
根据NCBI数据库中,2019-nCoV的NC_045512.2版本,2019新型冠状病毒的基因组序列是具有29903bp的单链RNA(ss-RNA)。这么少的遗传信息物质,却拥有10个基因,并经济高效地编码了这10个蛋白,而在许多高等生物中一个长点的基因就可以是30Kbp以上,可见这个病毒RNA基因组的简约。我们人类拥有30亿个碱基对、2万多个基因,但在2019-nCoV用不到人类万分之一的碱基序列、二千分之一的基因的攻击下,我们却节节溃败,这就是它的不简单。
在2019-nCoV基因组中,最长基因编码4405个氨基酸,这个蛋白是非结构性多蛋白,包括多个复制酶功能域。复制酶是一种依赖于RNA的RNA聚合酶,RNA聚合酶是RNA生成的催化剂。由于2019-nCoV不存在RNA病毒复制所需的RNA聚合酶,只有进入宿主细胞后,直接以病毒基因组RNA为翻译模板,表达出病毒RNA聚合酶。进而是应用这个酶完成负链亚基因组RNA的转录合成、各种结构蛋白mRNA的合成,从而进行病毒基因组RNA的复制。
冠状病毒感染会重新排列宿主细胞膜,以组装复制/转录复合体,在其中发生病毒基因组的复制和病毒mRNA的转录。在之前的基因组研究中,报告过已知nsp3和nsp4的共存会引起膜重排,但尚不清楚这两种蛋白相互作用的潜在机制。通过使用SARS-CoV的感染性cDNA克隆和复制子系统,nsp3-nsp4相互作用的丧失消除了病毒复制。所以如果能改变这个基因的复制酶功能域,或许可以揭示治疗乙型冠状病毒感染的抗病毒靶标。
2019-nCoV里的“护卫”“冲锋兵”“运输兵”
在冠状病毒基因组中,有三个基因是该病毒的“护卫”“冲锋兵”以及“运输兵”。
第一个[[S基因]],编码刺突糖蛋白,这是用于包病毒的外壳的蛋白。第二个[[M基因]],编码膜糖蛋白,负责营养物质的跨膜运输、新生病毒出芽释放与病毒外包膜的形成。另外[[E基因]],是很短的编码75个[[氨基酸]]的[[小包膜糖蛋白]],可以与包膜结合的蛋白。这三个家伙就形成了病毒蛋白的脂肪膜,把这个病毒“老大”(30K的单链RNA)给包起来。其实单链的RNA是十分不稳定,且容易变异,而且由于人体有大量的RNA酶会迅速消灭RNA,它只有在蛋白外壳的保护和引导下,才能进入人体“撒野”。
此外,该基因组中,如ORF3a和近缘病毒不同株系比对显得更“积极”,相似度为75%—91%,应该是冠状病毒变异的先驱基因,但功能不太明确;ORF7a是一个单次穿膜蛋白,和最近缘病毒的同源基因相似度较高,在84%以上,这个基因可能是冠状病毒的基本功能基因,从而序列较保守;ORF8是一个很诡异的基因,功能不太明确,但蛋白序列变异大,可能受自然选择压力较小,要不然变异率不会这么高;ORF10是一个核衣壳磷蛋白,该蛋白将病毒基因组包装到螺旋核糖核衣壳(RNP)中,并在病毒自组装过程中起基本作用。它是一种具有多种活性的蛋白质,与近缘病毒的同源基因相似度高达90%,这可能是因为该基因负责着病毒基因组包装的看家功能。
2019-nCoV与最近缘病毒的全基因组相似覆盖度为88%,相似度为82%。由于病毒没有化石,很难从基因组分化的角度判断不同病毒世代变异率。因而,2019-nCoV和地球的许多病毒一样,长期在人类周围,人类永远无法真正意义地“消灭”它们,只能驱离这10个基因早点远离我们的基因,从而避免它们进入人体当起“统治者”,指导里面2万多个基因里的部分“叛变者”的产物为它服务<ref>[http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2020-02/12/content_439794.htm?div=-1 2019新型冠状病毒“基因团伙”作案手法揭秘],科技日报,2020-02-12</ref>。
==声明==
转载此文是出于传递更多信息之目的。若有来源标注错误或侵犯了您的合法权益,请作者持权属证明与本网联系,我们将及时更正、删除,谢谢。
==参考资料==
[[Category:2019新型冠狀病毒]]
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'''[[2019新型冠状病毒]]'''(2019-nCoV),因2019年[[武汉]]病毒性肺炎病例而被发现<ref>[http://www.chinadevelopment.com.cn/sh/2020/0115/1601245.shtml 武汉市卫健委通报:1月13日无新增新型冠状病毒感染的肺炎病例],中国发展网,2020-01-15</ref>,2020年1月12日被[[世界卫生组]]织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族,已知可引起感冒以及[[中东呼吸综合征]](MERS)和[[严重急性呼吸综合征]](SARS)等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株。
2019年12月以来,湖北省武汉市持续开展流感及相关疾病监测,发现多起病毒性肺炎病例,均诊断为病毒性肺炎/肺部感染。<ref>[http://m.news.cctv.com/2019/12/31/ARTIL1JxT1xYZ9uMgxwJRDmJ191231.shtml 武汉12月发现病毒性肺炎病例27例 大部分为海鲜城经营户],CCTV,2019-12-31</ref>
人感染了冠状病毒后常见体征有呼吸道症状、发热、咳嗽、气促和呼吸困难等。在较严重病例中,感染可导致肺炎、严重急性呼吸综合征、肾衰竭,甚至死亡。目前对于新型冠状病毒所致疾病没有特异治疗方法。但许多症状是可以处理的,因此需根据患者临床情况进行治疗。此外,对感染者的辅助护理可能非常有效。<ref>[https://mp.weixin.qq.com/s/Du_243oMplFskyNgpaU2aA 关于新型冠状病毒感染的肺炎,你应该了解!],微信公众账号 联合国,2020-1-21</ref>
==基因团伙==
冠状,指病毒的独特形状,作为一种大型病毒家族,冠状病毒常见于哺乳类和鸟类中。
与动植物基因组相比,2019新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组实在太简约,但并不简单。那么,2019-nCoV基因组中的这几个基因又是怎样“朋比为奸”的?
2019-nCoV基因组简约但并不简单
根据NCBI数据库中,2019-nCoV的NC_045512.2版本,2019新型冠状病毒的基因组序列是具有29903bp的单链RNA(ss-RNA)。这么少的遗传信息物质,却拥有10个基因,并经济高效地编码了这10个蛋白,而在许多高等生物中一个长点的基因就可以是30Kbp以上,可见这个病毒RNA基因组的简约。我们人类拥有30亿个碱基对、2万多个基因,但在2019-nCoV用不到人类万分之一的碱基序列、二千分之一的基因的攻击下,我们却节节溃败,这就是它的不简单。
在2019-nCoV基因组中,最长基因编码4405个氨基酸,这个蛋白是非结构性多蛋白,包括多个复制酶功能域。复制酶是一种依赖于RNA的RNA聚合酶,RNA聚合酶是RNA生成的催化剂。由于2019-nCoV不存在RNA病毒复制所需的RNA聚合酶,只有进入宿主细胞后,直接以病毒基因组RNA为翻译模板,表达出病毒RNA聚合酶。进而是应用这个酶完成负链亚基因组RNA的转录合成、各种结构蛋白mRNA的合成,从而进行病毒基因组RNA的复制。
冠状病毒感染会重新排列宿主细胞膜,以组装复制/转录复合体,在其中发生病毒基因组的复制和病毒mRNA的转录。在之前的基因组研究中,报告过已知nsp3和nsp4的共存会引起膜重排,但尚不清楚这两种蛋白相互作用的潜在机制。通过使用SARS-CoV的感染性cDNA克隆和复制子系统,nsp3-nsp4相互作用的丧失消除了病毒复制。所以如果能改变这个基因的复制酶功能域,或许可以揭示治疗乙型冠状病毒感染的抗病毒靶标。
2019-nCoV里的“护卫”“冲锋兵”“运输兵”
在冠状病毒基因组中,有三个基因是该病毒的“护卫”“冲锋兵”以及“运输兵”。
第一个[[S基因]],编码刺突糖蛋白,这是用于包病毒的外壳的蛋白。第二个[[M基因]],编码膜糖蛋白,负责营养物质的跨膜运输、新生病毒出芽释放与病毒外包膜的形成。另外[[E基因]],是很短的编码75个[[氨基酸]]的[[小包膜糖蛋白]],可以与包膜结合的蛋白。这三个家伙就形成了病毒蛋白的脂肪膜,把这个病毒“老大”(30K的单链RNA)给包起来。其实单链的RNA是十分不稳定,且容易变异,而且由于人体有大量的RNA酶会迅速消灭RNA,它只有在蛋白外壳的保护和引导下,才能进入人体“撒野”。
此外,该基因组中,如ORF3a和近缘病毒不同株系比对显得更“积极”,相似度为75%—91%,应该是冠状病毒变异的先驱基因,但功能不太明确;ORF7a是一个单次穿膜蛋白,和最近缘病毒的同源基因相似度较高,在84%以上,这个基因可能是冠状病毒的基本功能基因,从而序列较保守;ORF8是一个很诡异的基因,功能不太明确,但蛋白序列变异大,可能受自然选择压力较小,要不然变异率不会这么高;ORF10是一个核衣壳磷蛋白,该蛋白将病毒基因组包装到螺旋核糖核衣壳(RNP)中,并在病毒自组装过程中起基本作用。它是一种具有多种活性的蛋白质,与近缘病毒的同源基因相似度高达90%,这可能是因为该基因负责着病毒基因组包装的看家功能。
2019-nCoV与最近缘病毒的全基因组相似覆盖度为88%,相似度为82%。由于病毒没有化石,很难从基因组分化的角度判断不同病毒世代变异率。因而,2019-nCoV和地球的许多病毒一样,长期在人类周围,人类永远无法真正意义地“消灭”它们,只能驱离这10个基因早点远离我们的基因,从而避免它们进入人体当起“统治者”,指导里面2万多个基因里的部分“叛变者”的产物为它服务<ref>[http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2020-02/12/content_439794.htm?div=-1 2019新型冠状病毒“基因团伙”作案手法揭秘],科技日报,2020-02-12</ref>。
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==参考资料==
[[Category:2019新型冠狀病毒]]