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影响生态平衡的因素有自然因素和人为因素。自然因素包括[[火山]]喷发、[[地震]]、[[海啸]]、[[泥石流]]和雷击火灾等。这些因素都可能在很短时间内使生态系统遭到破坏，甚至毁灭。但是，自然因素对生态系统的破坏和影响的出现[[频率]]不高，在地域分布上也有一定的局限性。影响生态平衡的人为因素包括毁坏植被，引进或消灭某一生物种群，建造某些大型工程（如大型水坝），以及现代工业和[[农业]]生产过程中排出某些有毒物质和向农田中喷撒大量农药（杀虫剂和除草剂）等。这些人为因素都能破坏生态系统的结构和功能，引起生态失调，使人类生态环境的质量下降，甚至造成生态危机。有些污染物能够沿着食物链逐级转移和富集。如脂溶性农药DDT经生物富集后，在生物体内的量往往比进入环境的初始量高几万倍，甚至几百万倍。进入高位营养级的污染物还可能通过食物链进入人体，危及人类的健康和安全。因此研究各种人为因素对生态平衡所造成的影响，是[[生态学]]的重要任务之一。