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1982年，[[湖北省人民政府]]批准設立“湖北神農架省級自然保護區”。1985年10月，升格為國家級自然保護區。1990年12月17日，成為聯合國教科文組織世界生物圈保護區網的一部分。2016年7月17日，神農架正式列入世界自然遺產名錄，成為中國第50項世界遺產，也成為中國首個同時獲得[[聯合國]]教科文組織世界生物圈保護區網絡、世界地質公園網路、世界遺產三大保護制度共同錄入的保護區 <ref>[http://www.china.com.cn/newphoto/city/2016-07/18/content_38903898.htm 湖北神农架申遗成功 弥补世界遗产名录空白[组图]]，中国网，2016-07-18</ref> 、地質遺跡和遺產地。世界遺產範圍區域包括神農頂和老君山，這一區域是中國生物多樣性最為豐富的三大區域之一，不但為許多珍稀動植物提供了生存環境，同時也為植物學、動物學與生態學研究提供了極為珍貴的資源和範例。大九湖濕地則被批准納入國際重要濕地名錄，並且是中國神農架世界地質公園的其中一個園區。